收集和分析了重庆市84个农村黑臭水体的水质和沉积物氮磷监测数据，并采用综合污染指数法和有机指数法法对水质和沉积物污染进行了评价。结果表明，87%的黑臭水体存在不同程度的氮磷污染，50%的水体氮磷同时超标。河流和沟渠的氮污染比池塘严重。沉积物受到总氮、有机氮和总磷的污染，70.2%的沉积物受到有机污染。水质中总磷、全氮和氨氮三项指标之间存在显著相关性，沉积物中有机质、全氮和总磷之间没有显著相关性。沉积物总磷与水质总磷之间存在显著的正相关关系，但相关性较弱。沉积物中的总氮与水质中的总氮之间没有显著相关性。总的来说，重庆市农村黑水和臭水的氮和磷污染主要是外部污染。