现代社会经济的快速发展和城市人口的快速增长给交通运输业带来了巨大的运营困难。由此产生的车站、车厢拥挤、交通网络延误等问题，已成为我国智慧交通建设面临的重要问题之一。针对城市轨道交通高峰时段客流组织过大导致站台候车旅客出行安全问题，以城市轨道交通单条线路为研究对象，提出了一种考虑预警机制和运营方案的多站客流控制方法，为高峰小时客流控制提供了理论依据。首先，考虑列车运行方案、车站客流控制和乘客上下车过程的约束，建立了以乘客平均延误时间和车站最大平均客流限制时间为目标的数学模型。决策变量是进入车站的乘客人数和车站的平均流量限制时间，使用线性加权方法将原始目标模型转换为单目标模型。在此基础上，根据问题的特点，设计混合禁忌搜索算法来解决它。最后，通过数值实验分析了问题的特点，并通过多组数值算例和实际案例验证了模型的正确性和算法的有效性。结果表明，考虑车站平均客流限制时间可以提高乘客的公平性，缓解跨线车站的客流拥挤。合理设置站台客流预警级别可以提高乘客的出行满意度。采用大小交路与小交路列车不同编组的混合策略，可以在一定程度上提高运输效率，降低企业成本。对于大规模问题，可以在短时间内解决混合禁忌搜索算法问题，并获得更高质量的解决方案。