目的：观察柴枳平肝汤治疗功能性消化不良不协调综合征的疗效。方法：选择肝胃78例功能性消化不良脉不协调患者为研究对象。根据随机数字表法，他们被分为对照组和观察组，每组39例。对照组用多潘立酮治疗，观察组用柴枳平肝汤治疗。比较两组治疗前后的临床疗效、中医证候评分、胃功能指数[胃动素（MTL）、胃蛋白酶原（PG）、胃泌素（GAS）]水平、生活质量[简明健康调查量表（SF-36）]评分及不良反应发生率。结果：观察组总有效率为97.44%，高于对照组的71.79%，差异有统计学意义（P<0.05）。治疗后，观察组的胁肋疼痛、脘腹胀满、打嗝和反酸的中医证候评分均低于对照组，差异有统计学意义（P<0.05），生理功能、生理功能、躯体疼痛、一般健康状况、能量、社会功能、，观察组的情绪功能和心理健康水平显著高于对照组（P<0.05）。观察组不良反应发生率为2.56%，低于对照组的25.64%（P<0.05）。结论：柴枳平肝汤能提高临床疗效，降低中医证候积分，提高胃功能指标水平，提高患者生活质量，安全性高。其效果优于多潘立酮。