目的了解中学生对2019冠状病毒疾病疫苗接种意愿及其影响因素，为加快中学生2019冠状病毒疾病疫苗接种的实施提供参考。方法采用自行设计的问卷对北京、安徽安庆、陕西、西安和广东深圳4座的9153名初中生和高中生进行调查。采用单因素分析和多类Logistic回归分析，探讨了中学生2019冠状病毒疾病疫苗接种意愿的相关因素。结果2019冠状病毒疾病疫苗接受率为60.05%，犹豫率为31.59%，耐药率为8.36%。在性别、是否居住在学校、学校分区、地区、周围学生的意愿、他人想法的影响、对新冠病毒的恐惧和新冠病毒的感染风险等群体中，接种意愿的分布存在统计学显著差异（2=8.43~1059.43，P<0.05）。多分类Logistic回归分析的结果表明，以疫苗接受组为参照，女孩、非居民、北京和安徽的两个地方，不同意或不确定，受周围学生意愿的影响，不同意或不确定，受他人想法的影响，不确定他们是否害怕新冠病毒的中学生，他们不同意或不确定新冠病毒的感染风险，更可能犹豫接种疫苗（OR值：分别为1.22、1.21、1.49、1.69、1.75、2.54、1.41、2.32、3.32、1.99和2.38，P<0.05）。不在学校、北京和陕西地区生活的中学生，不同意或不确定是否会受到同学的影响，不同意或不确定是否会受到他人思想的影响，他们并不害怕新冠病毒，对新冠病毒的感染风险不一致或不确定的人更有可能产生疫苗耐药性（kwitt分别为1.27、2.29、1.46、3.88、2.37、2.31、1.47、2.14、4.24和1.47，P<0.05）。结论4个城市的中学生对2019冠状病毒疾病的接种意愿较低。应采取干预措施，加快疫苗接种工作，建立免疫屏障。