基于虚拟筛选从中药中发现抗铜绿假单胞菌的活性成分
作者:徐明鑫; 陈双扣; 管天冰; 任风鸣; 滕金凤; 谭小庆
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针对铜绿假单胞菌的耐药性问题,利用虚拟筛选技术快速筛选具有抗铜绿假单胞菌活性的中药成分。用autodock Vina程序研究了铜绿假单胞菌LasR信号受体蛋白地区2uv0、3ix3和6mvm的三种共晶结构。然后,利用lipinsky规则对陶术中药数据库进行初步筛选,并通过分子对接再次筛选。对符合lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物进行了体外抗菌实验。结果表明,3ix3靶蛋白分子对接模型具有较强的活性分子富集能力。基于该模型对陶术中药数据库进行虚拟筛选,得到7个符合Lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物,通过网格筛选得到5个潜在活性分子。体外抑菌实验表明,黄芩素-7-甲醚具有明显的抑菌活性,其最低抑菌浓度为500g·ml-1。本研究发现黄芩素-7-甲醚具有良好的抗铜绿假单胞菌活性,对新型抗菌药物的研发具有一定的参考价值。