基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪干预腹膜纤维化的机制

作者:朱项君; 李柠; 吕丹; 魏萍; 俞曼殊; 盛梅笑; 张露
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目的利用网络药理学方法和分子对接技术探讨黄芪干预腹膜纤维化的可能机制。方法利用系统药理学数据库和分析平台(Eiffel-Tower)搜索黄芪的主要化学成分和作用靶点,并将相关药理成分作为潜在活性成分进行报道。以peritoneal fibrosis为关键词,获取OMIM和Genecards目前已知的与腹膜纤维化相关的疾病靶点,然后取两者的交叉靶点。对于交叉基因,通过STRING数据库和Cytoscape3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络和蛋白质相互作用(PPI)网络,并筛选核心网络。在R软件Bioconductor生物信息软件对GO和KEGG对核心靶标富集分析的基础上,AutoDock软件最终对主要有效成分与核心靶标进行分子对接,以获得其结合能力。结果筛选出黄芪的20个有效成分和文献报道的4个相关药理作用,457个药物靶点与674个腹膜纤维化靶点交叉,获得86个共同靶点。GO功能富集分析表明,黄芪抗腹膜纤维化主要涉及调控蛋白激酶B信号转导、细胞对化学应激反应、调节炎症反应等途径。KEGG途径富集分析主要涉及肿瘤、磷脂酰肌醇-3-羟激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGERAGE)、人类-巨细胞病毒感染-HIF-1信号通路等的调节。分子对接结果表明,关键靶点与活性成分具有良好的结合能力。结论黄芪治疗腹膜纤维化的分子机制可能与抑制炎症和炎症、调节多种信号通路有关。