基于网络药理学和分子对接探讨活络效灵丹治疗骨关节炎的作用机制

作者:李沿鑫; 王爱国; 陆贲琪; 贾易臻; 赵允; 陆军
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目的基于网络药理学和分子对接技术探讨活络效灵丹治疗骨关节炎的机制。方法采用TCMSP数据分析平台和文献检索方法,获取活络效灵丹的活性成分,并选择30%的出口服务生物利用度(OB)和0.18个药物类别(DL)的成分作为潜在活性成分。通过Uniprot数据库预测了与潜在活性成分对应的基因。查询GeneCards、OMIM、TTD、Drug·Bank和Pharmgkb的数据库,获取骨关节炎的相关目标,并进行重复数据消除和合并。利用Cytoscape3.8.2软件建立可视化网络图,根据度值选择核心药物的潜在活性成分。通过分析String数据库,获得了药物和疾病的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。使用Cytoscape3.8.2软件对网络进行拓扑分析,并通过GO富集分析和KEGG浓缩分析对潜在目标进行分析。使用SYBYL-X2.0软件进行分子对接验证。结果活络效灵丹有120种活性成分,201个作用靶点和1675个骨关节炎相关靶点。通过PPI网络和拓扑分析,得到184个节点和282条边。木犀草素和槲皮素是活络效灵丹的主要活性成分。在生物过程中,靶标主要通过细胞对化学应激的反应发挥作用。在分子功能方面,靶点主要影响核受体的活性。分子对接结果表明,夏洛克·MAPK1号、夏洛克·MAPK14号、RELA和西马基安能够稳定对接木犀草素、槲皮素等国作为目标。结论活络效灵丹可能通过调节多个靶点及相关信号通路,影响细胞凋亡、软骨基质降解,抑制关节炎和骨损伤,从而延缓骨关节炎的发展。