目的筛选转录组测序雌性小鼠与雄性C57BL／6J小鼠的差异基因和途径，为进一步探索雄性和雌性小鼠行为差异的分子机制奠定基础。方法8周龄C57BL／6J品系雌性和雄性小鼠完全分离小鼠海马组织。在提取了整个RNA后，逆转录建造了cDNA文库，并在华大基因平台上生成了50个基地的单终端读数，以供分析。测序后，基于GO和KEGG数据库，结合R语言的phyper函数，对数据进行筛选、修正和充实，以计算P值。然后，P值被纠正以获得Q值。基于超几何测试方法分析注释的不同基因表达，以筛选不同性别小鼠中的不同基因和途径。测序后，使用实时荧光定量PCR（RT Lebana）验证在雄性和雌性小鼠海马中筛选的差异基因，并比较不同信号通路中差异基因的表达。结果通过比较男女差异，筛选出325个差异基因，其中上调基因233个，下调基因92个。这些差异基因的功能主要集中在长时程增强（LTP）、钙离子信号通路、尼古丁成瘾等过程中。在男女差异的基因互作网络中，有362个连接点和1703条互作边。筛选出的10个核心基因是：甲基酶5D赖氨酸（Kdm5d）、细胞周期蛋白依赖性激酶5（Cdkl5）、细胞出口培养基（Cle1）、多巴胺受体6a3（Slc6a3）盒式转录因子（Fox）、前体mRNA加工因子4B（Prpf4b）、甘氨酸受体4（夏洛克·Glur4）、钙离子受体2（camk2）、DNA和RNA结合蛋白家族（Son）、5－羟色胺受体5b（Htr5b）。RTqPCR验证的结果与测序结果一致。结论从雄性和雌性小鼠海马中筛选异基因基因，为研究不同性别小鼠的行为差异提供了实验思路，并为后续的小鼠行为研究提供了有针对性的实验设计。