目的筛选骨肉瘤潜在的关键基因并分析其免疫浸润模式。方法从GEO基因表达综合数据库获取与骨肉瘤有关的基因表达谱、GSE16088和GSE12865。使用生物信息学方法筛选与骨肉瘤有关的差异表达基因（DEGs），并进行基因本体（GO）功能注射、京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析和免疫细胞浸润分析。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络筛选骨肉瘤潜在的关键基因，并使用癌症基因组图谱数据库（TCGA）验证关键基因在骨肉瘤和正常组织样本中的表达。结果共筛选出108名DEGs。GO功能注释和KEGG富集分析表明，DEGs主要在整合素结合、细胞外基质（ECM）结构成分、ECM受体相互作用和磷脂酰肌醇3激酶／蛋白激酶B（PI3K／Akt）信号通路中富集。巨噬细胞是骨肉瘤的主要免疫浸润细胞。5个关键基因在骨肉瘤和正常组织中的表达存在差异（P<0.05）。结论SPP1号、MMP2号、LOX、COL5A2和夏洛克·MCAM在骨肉瘤的表达上调，这可能是骨肉瘤潜在的生物标志物。巨噬细胞是骨肉瘤主要的免疫浸润细胞，这为骨肉瘤的治疗提供了新的方向。